Solución con CMD
Paso 1.
Conecta el Pendrive Infectado a una PC pero ATENCIÓN no lo habrás. No debe ser la computadora con la cual se infecto el pendrive
Paso 2.
Revisa en la carpeta Equipo que letra de Unidad es tu Pendrive. En este Ejemplo la letra seria la E:
Paso 3.
Ve a Inicio y Escribe cmd y oprime Enter
Paso 4.
Con una Ventana abierta escribe la letra de la Unidad de tu Pendrive seguido de : luego dale Enter
Paso 5.
Una vez te figure como en Ejemplo de la Foto escribe seguido attrib /s /d -r -h -s *.*
Paso 6.
Entra a Equipo y revisa tus archivos en tu prendrive y borra los accesos directos.
Precaución a tener en cuenta
Se recomienda Limpiar con Antivirus la Computadora donde se infecto el Pendrive si no se volverá a infectar y tendrá que hacer nuevamente estos pasos.